Виділено 18 основних мутаційних кластерів (скарб), що позначаються латинськими літерами від A до R. Порядок букв відображає послідовність мутацій. Ці скарби у свою чергу розгалужуються на гаплогрупи, які нумеруються цифрами та літерами.
Для того щоб дізнатися про свою етнічну приналежність на основі гаплогрупи необхідно здати біологічний матеріал. Стандартним зразком вважається ротовий мазок – зіскрібок буккального защіпкового епітелію. Після цього ДНК лабораторія проводить дослідження та визначає гаплогрупу.
Найбільш поширеними у українців Y-хромосомними гаплогрупами є R1a та I2a. Найчастіше зустрічається гаплогрупа R1a-Z280 (43%).