Основною функцією гладкої ендоплазматичної мережі є синтез ліпідів (жирів). Наприклад, ЕПС епітелію кишківника синтезує їх із жирних кислот і гліцерину, що всмоктуються з кишківника. Потім ліпіди потрапляють у комплекс Гольджі.
Синтез гормонів До гормонів, які утворюються в агранулярній ЕПС, належать, наприклад, статеві гормони хребетних тварин і стероїдні гормони надниркових залоз.
Шорсткий ЕР [ШЕР (rER)](1) – місце активного біосинтезу білків. Саме тут синтезуються білки, які функціонуватимуть у складі мембран, лізосом або секретуватися з клітини. Решта білків синтезуються в цитоплазмі на рибосомах, не пов’язаних із мембранами ЕР.
Гладкий ендоплазматичний ретикулум синтезує ліпіди та вуглеводи, необхідні для мембран клітин.